В марте 1959 г. были начаты работы по строительству, и уже через три года после начала стройки состоялся выпуск первой продукции оборонного назначения. С 1962 г. завод стал непосредственным участником производства баллистических, затем крылатых ракет, строительства многоцелевых подводных лодок, подводных крейсеров стратегического назначения и надводных кораблей. Алтайский край стал иметь самое прямое отношение к обороне страны.

Изначально завод получил наименование «Алтайский электромеханический завод» (АЭМЗ). По производственный планам в 1960 г. стояли задачи по выпуску приборов управления баллистическими ракетами. Для выпуска уникальных особо точных гироскопических приборов решающее значение имела подготовка кадров, поэтому молодых специалистов, а также руководителей подразделений с целью практического обучения всем тонкостям производственного и организационного процесса, направляли в длительные командировки на родственные предприятия страны.

В первые годы своего существования в жестких условиях отсутствия на заводе достаточных производственных мощностей (активное строительство производственных объектов и поселка жилого комплекса для сотрудников предприятия продолжалось в течение нескольких лет и после запуска предприятия), молодой коллектив завода с честью справился с первым выпуском запланированного объема продукции оборонного значения. Завод вошел в число действующих предприятий, и это стало первой победой коллектива.

Со второй половины 60-х годов Алтайский приборостроительный завод «Ротор» (наименование введено с января 1966 года) стал предприятием серийного изготовления гироскопических приборов и навигационных комплексов для нужд ВМФ СССР.

Интенсивно формировался трудовой коллектив АПЗ «Ротор», численность которого без занятых в непромышленных организациях завода возросла до 5 тысяч человек. Был создан высокий кадровый потенциал. Он позволял осуществлять в жесткие директивные сроки освоение и серийный выпуск практически любых самых сложных приборов и комплексов. Уже с 60-х годов и последующие десятилетия сложился преобладающий производственный профиль завода — выпуск гироскопических приборов и систем автоматического управления, уникальных навигационных комплексов I, II, III поколения. 

Кроме специальной продукции, отличавшейся высоким качеством и надежностью, с 1966 года завод «Ротор» начал выпускать товары народного потребления. Это были приборы зажигания для автомашин, кухонные весы, сувениры, стабилизаторы для черно-белых и цветных ТВ, игровые автоматы, стоматологические аппараты, электромиксеры, счетчики электроэнергии, ультразвуковые установки и многое другое.

В 90 — е годы завод переживал тяжелейший финансовый кризис, вызванный резким сокращением, вплоть до обнуления, государственного оборонного заказа. В 1994 году завод был преобразован в открытое акционерное общество Алтайский приборостроительных завод «Ротор». Началом выхода предприятия из катастрофического кризисного состояния явился 2002 год, когда последовательно и целенаправленно стали осуществляться принятые приоритетные направления хозяйственной деятельности. В течение нескольких лет предприятие вышло из глубокого финансового кризиса и перешло к эффективной хозяйственной деятельности. В настоящее время успешно реализуются основные направления стратегического развития завода.

В рамках конверсии военного производства в течение 1990 — 1997 гг. были созданы производственные мощности по выпуску широкого ассортимента товаров народного потребления и другой гражданской продукции. С 2002 г. проводится активная работа по повышению качества товаров народного потребления, их дизайна, упаковки и сервисного обслуживания. Были модернизированы мясорубки, зернодробилки, сепараторы, медицинская техника и др. Освоены и выпускаются новые изделия — электросушилки, новые зернодробилки, автотовары. Выполнение комплекса маркетинговых, конструкторских, технологических, производственных и организационных мероприятий в рамках развития производства ТНП обеспечило сохранение конкурентоспособности гражданской продукции в течение 2002-2012 гг., физические объемы производства которой выросли в 3,5 раза. Почти все изделия являются в настоящее время лауреатами конкурса «Лучший алтайский товар», тринадцать из них входят в число лауреатов ежегодного конкурса «100 лучших товаров России», а сушилка электрическая «Дива Люкс с электронным управлением» получила высшую награду всероссийского конкурса «100 лучших товаров России 2023» и вошла в «золотую сотню» лучших товаров России.

«Ротор» постоянно сотрудничает с организациями и предприятиями судостроительной промышленности и генеральным заказчиком — Главным управлением навигации и океанографии Министерства обороны РФ, концерном ЦНИИ «Электроприбор», Амурским судостроительным заводом, ФГУП «Звезда» (г. Большой Камень) и другими заказчиками; а также с предприятиями авиапрома — Иркутским авиационным заводом, машиностроительным конструкторским бюро «Вымпел» (г. Москва), ОАО НПП «Звезда» (Московская область), ОАО «Новосибирский завод имени Коминтерна», НПП «Иглим» (г. Баку). По заказам этих предприятий освоена и выпущена новая продукция оборонного назначения 60 наименований. За большой вклад в производство современных высокоэффективных навигационных приборов и гироскопических устройств завод «Ротор» награжден в год 100-летия подводных сил России (2006 г.) дипломом Торгово-промышленной палаты РФ.